中药材内生菌质量标志物数据
DIP2024000014728
陈朋,刘英杰
首次登记
3年
2024-11-04 21:05:18
科学研究和技术服务业
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近年来随着国家对于中药材质量重视程度的增加,越来越多的新方法被用于评定中药材质量。由于中药材中含有丰富的内生菌,而内生菌与寄主植物的代谢过程和活性药用化合物的产生有着错综复杂的联系,因此内生菌直接影响中草药的质量和道地性。本数据集汇集天麻、黄芩、柴胡、黄精、肉苁蓉五种中药材内生菌的详细信息,从微生物角度出发为中药材质量标志物的筛选奠定基础,方便人们了解天麻、黄芩、柴胡、黄精、肉苁蓉内生菌的研究现状,并为中药材研究例如道地性分析提供可靠的数据来源。
通过检索与天麻、黄芩、柴胡、黄精、肉苁蓉五种中药材内生菌相关的文献,从文献中筛选并获取了有关内生菌的详细信息,包括菌种名称、宿主植物、文献中的植物来源、分类、属、科、目、纲、门、功能/生物学作用、技术、16S rRNA/16S rDNA/ITS 序列长度、NCBI/GenBank参考序列号、参考文献、链接。此外,我们还添加了算法文件,对每个属的内生菌进行了统计分析,原始算法文件(名称:Endophytes analysis of QMD)可通过访问https://doi.org/10.57760/sciencedb.18208获得。其中,表1(Endophytes frequency)统计了每个宿主中所有属在文献中出现的总频率和对应不同文献的篇数,设定这两项指标之和即总频率大于2的属作为该宿主的高频内生菌,并突出显示。在表2(Statistic analysis)中,补充了表1中高频菌在其他四种宿主中对应的总频率,并计算了每种高频菌分别在五种宿主所有高频菌中所占的比例(高频内生菌总频率/宿主中的高频内生菌总频率之和)及标准差,原始算法文件中列出了详细的公式及计算过程供参考。
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